近年来日本各地不断被名为异生兽的物种袭击，日本政府为此专门成立了一个秘密对抗组织TLT-J。故事还是要追溯到一年前，日本航空自卫队队员真木舜一在一次偶然的任务中遇到了奈克斯特奥特曼（奈克瑟斯奥特曼的前身），并且与之合体，成为了第一任适能者。
《奈克瑟斯奥特曼》是一部十分值得成年朋友观看的作品，但由于本作剧情黑暗，使得收视率不断走低，导致了本剧从原定的52话缩水到了38话，成为了平成系奥特曼史上收视率最低的作品。尽管如此，本剧从各方面来说均为最别具一格而独一无二的一部作品，是一部面向成年人的悬疑型特摄连续剧。它对于成年特摄迷的吸引力依然没有消失，一直传承至今。
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