在上一期文章中，我们介绍了如何在线高效完成蛋白序列比对，并获得了 .fasta 或 .fa 格式的比对结果文件
。本期，我们将通过 ESPript 工具，将这些比对结果转换成清晰、美观的图，让研究成果轻松达到出版级别。
ESPript (Easy Sequencing in PostScript) 是一个专为学术研究者设计的在线工具，可以将序列比对结果可视化，并结合二级结构信息呈现，为序列相似性分析和发表提供强大支持。
ESPript 的主要特点包括：
开发与维护团队：由法国 CNRS / 里昂大学的 Patrice GOUET 和 Xavier ROBERT 主导开发，当前版本为 ESPript 3.x。
ESPript 3.x 的官方网站是：https://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/index.php
在设置界面中，按需调整以下参数：
设置比对图的整体风格：
提交后，页面会跳转到结果窗口，可在 “RESULTS” 板块找到绘图输出文件。
结果中，如果某个位置氨基酸在物种间保守是黑色背景，白色字，我们可以看出我们比对的这个蛋白在目前选择的三个物种间并不是十分保守。
Tips: 如果初次结果显示序列保守性较低（如上图白色区域较多），可以调整比对的物种范围。例如，在哺乳动物中重新选择物种后生成的比对结果如下：
可以看到，T2R41蛋白在哺乳动物中深黑色区域更多，更加保守。
使用 ESPript，可快速将蛋白序列比对结果转换成出版级别的专业图，并通过合理设置进一步优化输出效果。无论是论文发表还是会议展示，ESPript 都能为您的科研成果提供有力支持。
