谢邀，我先来回答你的问题。
Q:为何黑格尔认为宗教高于自然科学，哲学又高于宗教？
A:这个“高于”应该是指理论的完善程度。黑格尔运用“密涅瓦的猫头鹰”这一例子来说明哲学是自然科学的总结。而宗教其实也和自然科学有关，比如《圣经》中对自然的概括性描述，新教对自然科学的支持。而哲学的形而上学问题包含万物，体系完备，随时代发展，因此黑格尔认为哲学高于宗教。
Q:绝对精神是代表了绝对的进化到最高级，自我完善的功能是不是就是最高级的进化是历史和人类追求的终极目标？是真实的终极真理吗？
A:这是黑格尔辩证法的观点，但进化和退化这一对矛盾是共存的，在某些方面进步了就会有退步。我不认为存在一种最高级的进化并且能作为目标而前进，这种是理想化的历史观。所以它也不是什么终极真理。Q:如何在理性的思维下辩驳黑格尔的“存在即为合理”？
A:为什么要辩驳呢？黑格尔是说，万物的存在，都合乎理由。没有什么是凭空产生的。这里的合理不是合乎人类，而是合乎绝对精神。其实黑格尔那句话说的是
他不是指现存的所有事物都是现实的，而是
Q:如何在理性思维下肯定奥卡姆剃刀原理？爱因斯坦试图建立统一场理论的思路是否和他的哲学观念有关？
A:奥卡姆剃刀原理已经广为人知，甚至被人们滥用，成为人们避免麻烦的借口。我认为，奥卡姆剃刀使用的原因不是为了简便，而是为了精准。奥卡姆认为“如无必要，勿增实体”，可以体会一下。至于爱因斯坦，我就不知道了。
另外，奥卡姆剃刀的实际可操作性并没有想象中好用。
贴一篇我写的“哲学听课笔记”
我们不重视中世纪的很大一个原因是黑格尔在《哲学史讲演录》中提到的:"整个中世纪哲学可以穿七里靴一路而过"（德国神话中的神行物）
黑格尔如此说，因为他是从图宾根神学院毕业的，他已经对神学产生逆反心理了，所以他不想多谈神学。黑格尔是近代人物，他希望更多谈论近代哲学而不是中世纪哲学。所以当谈起中世纪哲学，黑格尔即使非常了解，也不愿意说。
徐英瑾认为:"黑格尔的很多研究方案、很多思想，我认为是受到托马斯–阿奎那基本的了解、影响。因为托马斯–阿奎那的一个基本想法是:认识上帝有两条路，一条是通过顿悟的奥古斯丁的方式，另一种是通过理智把握的方式——这是信仰和知识的结合。以后的黑格尔都是亦步亦趋地都是按照这个方案来行动的，他因此也就反对从马丁–路德到康德的那个传统，而认为知识理性和宗教信仰间应当划一个界线。这里不是明显地看到了托马斯–阿奎那的痕迹吗？而且他的整个自然哲学里面，对于世界万物的整个自然品性，按照它内在精神品性所做的分级，非常像托马斯–阿奎那的那种自然哲学。"
在黑格尔哲学里，"绝对精神"取代了上帝，但是它的本质没有变，仍然是严格的，有序的，固定的。
此外，黑格尔在研究历史哲学时，把世界分为四大阶段:东方王国，古希腊王国，罗马王国和基督教王国。这实际上是把奥古斯丁以来的对"城市世界"和"上帝之城（天国）"的二元化以一种动态的方式来进行。越往后的天国越接近所谓的天国（发展观）
黑格尔说自己不重视中世纪的原因是说明其思想的"原创性"。
黑格尔的美学理论受中世纪影响非常大。他深入研究的正是西方神学中的艺术理论。综上可以说明黑格尔与神学的关系。（本课程笔记来自徐英瑾教授的现代西方哲学）
参考资料：黑格尔《小逻辑》p43.44.300
