
看很多小伙伴不知道荧光定量怎么做,想想自己也算个荧光定量老油条了,我这里大概分享一下我的实验流程和一些小技巧,有需要的话可以参考一下。
我做的是B淋巴细胞的荧光定量,RNA提取出来的浓度大概250ng/ul,反转录用了4ul,cDNA的浓度就有1000多ng/ul了,反转录试剂盒是新贝的。
后面做荧光定量我们实验室用的是擎科的qPCR MIX,体系是10ul体系,cDNA模板加了1ul,用的仪器是QuantStudio 7 flex system,所以配体系的时候还要多加0.2ul的ROX。这里加样的时候我们有个习惯,因为我们用的体系比较小,单独一个个加的话误差比较大,所以我们是提前把要相同的组分预混好,后面再分装,这里有个要注意的地方,加样前一定要确保试剂完全融化了,然后一定要混匀!加样的时候可以点在壁上,之后一定要离心!血泪的教训。
对了,补充下我们加样用的是爱思进的透明PCR板,个人感觉透明的比白色的好用,封板膜我们用的是ABI的,除了贵没啥缺点。
然后扩增程序就按照说明书设置,熔解曲线用的仪器默认的,大概跑一个半小时跑完。
以下是我的部分结果
我这里用了不同的cDNA模板和相同的引物,CT值在20-31之间,熔解曲线都是单峰,最后结果算出来也是符合预期的。这里也有要注意的地方,不同公司的试剂的荧光强度天生就不一样,一起跑就会有高有低,但是结果跟高低没有关系,看CT值就行。但是像我们用的擎科的这款,如果跟其他的一块看的话就又矮又趴,那曲线就真心不好看。后来才发现这种就不能放一块分析,荧光强度差别大的要单独分析,像这个图上的就是单独分析,图就很漂亮。
之后就是分析结果了,一般重复性没问题,熔解曲线也没问题的,那数据就能用,照着公式代进去就行了,具体啥公式哪哪都有,我也不废话了。
荧光定量这个实验,刚开始做可能容易出问题,多做几次熟练了之后其实挺简单的,这也是我的一点个人经验,谁还不是从菜鸟进化过来的呢。
